在中央空调维修保养中，冷却系统中的微生物处理最为头痛，生长在冷却系统中的大多数微生物受到刚性细胞壁的束缚， 细胞壁赋予生物体特有的形状并提供机械强度，紧接在细胞壁内部的是细胞膜，其起细胞渗透屏障的作用，屏障允许细胞浓缩合意的化学物质，如营养素，并排除或排泄有毒或有害的化学物质，如废物，可以在膜上建立几个数量级的浓度梯度，所有的细胞必须花费大量的代谢能量来维持最佳的内部条件， 所有微生物的一个基本特征是能够在恶劣和变化的环境中保持细胞的必要组织和完整性。
在微生物细胞中使用的基本组成部分，以及最大量需要的组成部分是碳，氮和磷。微生物在获得碳的方法上有所不同。 绿藻，蓝细菌和某些细菌可利用二氧化碳作为唯一碳源并将其转化（“固定”）为细胞碳化合物。 大多数细菌，酵母和霉菌需要预先形成的碳化合物，并使用从非常简单到非常复杂的有机分子。 为了满足氮的需求，微生物“固定”大气氮或利用环境中存在的胺，亚硝酸盐和硝酸盐。 天然存在的和合成的无机和有机磷酸盐可用于满足微生物磷酸盐的要求。
微生物已经开发出许多方式从周围环境中提取能量。 藻类和其他光合生物捕获来自太阳的光能。 无机化学品，如氨，硫和氢，可被某些细菌氧化释放能量。 更常见的是，细菌，酵母菌和霉菌释放储存在有机化合物（如糖，蛋白质，脂肪，油，有机酸和醇）中的化学能。
在中央空调维修保养中，好氧生物利用氧气驱动释放化学能量的氧化， 厌氧菌不使用氧气，但可以用硫酸盐或硝酸盐等分子代替氧气。 在无氧能量产生过程中，这些氧化分子被还原，形成硫化物或氮气。 当没有可用的氧化剂时，一些厌氧菌仍然可以产生能量，尽管效率较低，通过将一半底物分子的氧化偶联到另一半的还原上。 通常，这种“发酵”反应的副产物是各种有机酸。
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